Магистратура в Чехии обычно длится от 2 до 3 лет, и двухлетние программы являются наиболее распространёнными.
Чешские университеты следуют традиционному графику: учебный год начинается в сентябре. В некоторых университетах возможен приём студентов на весенний семестр, но это скорее исключение, нежели обычная практика. Такие программы можно найти, например, в Карловом Университете и Масариковом Университете, однако получение регулярных стипендий для таких программ весьма ограничено.
Большинство программ ведётся на чешском языке, однако количество программ на английском языке постоянно растет. На сегодняшний день в Чехии предлагается несколько сотен магистерских программ полностью на английском языке. Но следует иметь в виду, что в некоторых случаях, даже если программа полностью на английском, студенты могут быть обязаны предоставить базовые знания чешского языка, особенно если планируется взаимодействие с местным населением или участие в практиках.
Магистратура в Чехии часто включает в себя междисциплинарные программы, позволяя студентам изучать современные концепции и вносить вклад в развитие науки и технологий. Учебные планы обычно включают лабораторные и полевые исследования, написание курсовых работ и диссертаций, а также стажировки в частных и государственных организациях, что обеспечивает тесную связь с различными секторами экономики и промышленности.